Ответ на этот вопрос зависит от дозы и состояния.

Исследования с участием сотен и тысяч пациентов показали, что 2-3 чашки кофе:

положительно влияют на потенцию
снижают риск деменции и болезни Альцгеймера
повышают чувствительность к инсулину и снижают риск диабета
снижают вероятность развития некоторых видов рака — кожи, печени, поджелудочной железы
замедляют прогрессирование рассеянного склероза
снижают вероятность инсульта
защищают от депрессии
уменьшают боли при мигрени
снижают заболеваемость кариесом зубов.
Вместе с этим:

эмаль зубов от частого употребления кофе темнеет
через 10 минут после употребления кофе давление повышается на 15 мм рт.ст.
кофе мешает забеременеть при процедурах ЭКО
кофе нарушает процесс засыпания, особенно в пожилом возрасте
кофе способствует вымыванию кальция из костей
кофе нарушает синтез гормонов щитовидной железы.